Endometriozisin tedavisi genel olarak ilaçlarla ya da ameliyatla yapılır. Sizin ve doktorunuzun seçeceği tedavi yöntemi bulgularınızın şiddetine ve hamile kalmak isteyip istememenize bağlı olarak değişkenlik gösterebilir. Genel anlamda doktorlar ilk olarak koruyucu tedavi yöntemlerini önerirler ve ameliyatı son çare olarak değerlendirirler.
Doktorunuz, ağrınızı gidermeye yardımcı olmak için ağrı kesici özelliğe sahip bazı ilaçlar tavsiye edebilir. Eğer verilen ilaçlarda maksimum doz ağrınızı azaltmaya yetmezse bulgularınızı kontrol altına almak için başka bir yöntem denemeniz gerekebilir.