Endometriozis kısırlığın en temel üç sebebinden biri yerine sayılmaktadır. Hafif veya orta derece vakalarda dahi kısırlık vakası yaşanabilir. Bu tür vakalarda yapışıklıkları, kistleri ve hastalıklı dokuları yok etmek için yapılan ameliyat doğurganlığı geri getirebilir. Ancak bazı vakalarda küçük bir oran da kadınlar doğurganlığını geri kazanamayabilir. Endometriozisin doğurganlığı nasıl etkilediği kesin olarak anlaşılamamıştır.